Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Bilgi İşlem Daire Başkanlığı
Meü
Biyoteknoloji Bölümü
Biyoteknoloji, belirli bir amaca yönelik olarak biyolojik sistemleri, canlı organizmaları veya bunların türevlerini kullanarak yeni ürünler ve süreçler geliştiren çok yönlü (multidisipliner) bir bilim dalıdır.
Multidisipliner Yapı:
Bu alan; biyoloji, kimya ve fizik gibi temel bilimlerin yanı sıra tıp, mühendislik ve bilgisayar bilimlerini bir araya getirir.
Mikrobiyoloji, moleküler biyoloji, genetik, biyoinformatik ve biyokimya gibi disiplinlerin entegrasyonu sayesinde biyoteknoloji, hem temel hem uygulamalı araştırmalarda güçlü bir sinerji yaratır.
Uygulama Çeşitliliği:
Biyoteknoloji; sağlık, tarım, gıda, çevre ve enerji üretimi gibi farklı sektörlerde sürdürülebilir çözümler sunar.
Mikrobiyal Biyoteknoloji (Sağlık Uygulamalarıyla Birlikte)
Mikroorganizmaların enzim, antibiyotik, vitamin, biyopolimer ve biyoyakıt gibi ekonomik değeri yüksek ürünlerin üretiminde kullanıldığı bir alandır.
Endüstriyel fermantasyon, biyolojik arıtım, biyoyakıt üretimi ve gıda teknolojisi uygulamalarında temel rol oynar.
Sağlık alanında, probiyotik bakterilerden türetilen biyoaktif maddeler, mikrobiyom temelli tedavi yaklaşımları ve antimikrobiyal ajanların geliştirilmesi gibi konular öne çıkar.
Genetik olarak düzenlenmiş mikroorganizmalar sayesinde aşı, insülin ve terapötik protein üretimi yapılabilir.
Bu yönüyle mikrobiyal biyoteknoloji, hem endüstriyel verimlilik hem de insan sağlığı açısından stratejik bir öneme sahiptir.
Biyoinformatik ve Hesaplamalı Biyoteknoloji
Biyoinformatik, biyolojik verilerin bilgisayar destekli analizi, depolanması ve yorumlanması süreçlerini kapsar
Genom, transkriptom ve proteom verilerinin analizi sayesinde, hücresel mekanizmaların anlaşılması ve yeni biyoteknolojik hedeflerin belirlenmesi mümkün olur.
Yapay zekâ ve makine öğrenmesi, ilaç keşfi, protein yapısı tahmini ve mikrobiyal topluluk analizleri gibi alanlarda etkin şekilde kullanılmaktadır.
Bu yönüyle biyoinformatik, modern biyoteknolojinin veri temelli karar mekanizmasını oluşturan temel bileşenidir.
Bitki Biyoteknolojisi
Bitki biyoteknolojisi, tarımsal verimliliği artırmak, hastalıklara ve çevresel streslere dayanıklı bitki türleri geliştirmek amacıyla modern genetik teknikleri kullanır.
Doku kültürü, gen aktarımı ve gen düzenleme (CRISPR/Cas9) gibi yöntemlerle, daha dayanıklı ve besin değeri yüksek bitki çeşitleri geliştirilmektedir.
Biyogübreler, biyopestisitler ve bitkisel metabolit üretimi, sürdürülebilir tarımın temelini oluşturur.
Ayrıca bitki biyoteknolojisi, biyoyakıt üretimi ve çevre dostu endüstriyel hammadde üretiminde de önemli bir potansiyele sahiptir.
Biyoteknolojinin GeleceÄŸi
Kişiselleştirilmiş tıp, sentetik biyoloji, mikrobiyom mühendisliği, biyoenformatik tabanlı yapay zekâ modelleri ve sürdürülebilir tarım sistemleri, biyoteknolojinin önümüzdeki dönemde hızla büyüyeceği alanlardır.
Bölümümüzün Araştırma ve Eğitim Altyapısı:
Bölümümüzün 3 adet Araştırma Laboratuvarı, 1 adet de Öğrenci Laboratuvarı mevcuttur. Laboratuvarlarımız modern cihaz ve ekipmanlara sahiptir.
Son İki Yılda Uluslararası Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
52. Nadeem, M. Molecular screening of septoria-resistant genes in historical Turkish bread wheat germplasm using the validated gene specific SSR markers. TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY, 2025, 48, 1-21.
10.55730/1300-011X.3251
51. Nadeem, M. Molecular screening of diverse Tomato germplasm for root-knot nematode resistance using the Mi23 marker. PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, 2025, 136, 102607-.
50. Nadeem, M. Applicability of Start Codon Targeted (SCoT) markers for the assessment of genetic diversity in bread wheat germplasm. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2025, 72, 14-.
49. AktaÅŸ, H.; Nadeem, M.; TutuÅŸ, Y.; DoÄŸan, S.; Karaman, M.; Erdemci, Ä.; Wang, M.; Gou, J.; Baloch, F. Mineral profiling of Turkish wheat genetic resources unveiled their conserved potential for biofortification in combating hidden hunger. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2025, 72, 4915-4929.
48. Nadeem, M. Molecular screening of septoria-resistant genes in historical Turkish bread wheat germplasm using the validated gene specific SSR markers. TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY, 2025, 49, 89-109.
47. Nadeem, M. Molecular screening of diverse Tomato germplasm for root-knot nematode resistance using the Mi23 marker. PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, 2025, 136, -.
46. Nadeem, M. Identification of Phenotypic Diversity and DArTseq Loci Associated with Vitamin A Contents in Turkish Common Bean Germplasm Through GWAS. PLANTS, 2025, 14, -.
45. Altaf, M.; Nadeem, M.; Ayten, S.; Aksoy, E.; Mansoor, S.; Karunathilake, E.; Chung, Y.; Baloch, F. Genome-wide association study of common bean (Phaseolus vulgaris L.) unveils novel loci governing root-to-seed zinc allocation. SCIENTIFIC REPORTS, 2025, 15, -.
44. Nadeem, M. Genotyping-by-sequencing derived SNP markers reveal genetic diversity and population structure of Dactylis glomerata germplasm. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2025, 16, -.
43. Soomro, S.; Soomro, S.; Altaf, M.; Liaqat, W.; Nadeem, M.; Baloch, F.; Aasım, M.; Mohamed, H. Development of tetraploids in tissue culture: modern techniques and biotechnological innovations. PLANT CELL, TISSUE AND ORGAN CULTURE (PCTOC), 2025, 160, -.
42. Baloch, F. Wheat2035: Integrating Pan-omics and Advanced Biotechnology for Future Wheat Design. MOLECULAR PLANT, 2025, , -.
2024
41. Aybar yalınkılıç, N.; Başbağ, S.; Altaf, M.; Ali, S.; Nadeem, M.; Shehzad baloch, F. Applicability of SCoT markers in unraveling genetic variation and population structure among sugar beet (Beta vulgaris L.) germplasm. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2024, 51, 1-12.
40. AktaÅŸ, H.; Nadeem, M.; TutuÅŸ, Y.; DoÄŸan, S.; Karaman, M.; Erdemci, Ä.; Lu wang, M.; Ying gou, J.; Baloch, F. Mineral profling of Turkish wheat genetic resources unveiled their conserved potential for biofortifcation in combating hidden hunger. GENET RESOUR CROP EVOL, 2024, 71, 1-15.
39. Altaf, M.; Nadeem, M.; Ayten, S.; Aksoy, E.; Sönmez, F.; çiftçi, V.; Baloch, F. Unveiling Genetic Basis Associated With Manganese Content in Turkish Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) Germplasm Through a Genome-Wide Association Study. PLANT BREEDING, 2024, , 1-25.
38. Yeşil bayrıl, B.; Bakhsh, A.; Nadeem, M.; Demirel, U. Elucidating the genetic diversity and population structure of international cotton germplasm using inter-primer binding site (iPBS) retrotransposon marker system. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2024, 71, 1737-1748.
37. Karaköy, T.; Toklu, F.; Tuğay karagöl, E.; Uncuer, D.; çilesiz, Y.; Ali, S.; Nadeem, M.; özkan, H. Genome-wide association studies revealed DArTseq loci associated with agronomic traits in Turkish faba bean germplasm. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2024, 71, 181-198.
36. Nadeem, M. Stripe rust resistance gene Yr15 in Turkish and Kazakhstan wheat germplasms and the potential of Turkish wild emmer for stripe rust breeding. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2024, 71, 2699-2719.
35. Aasım, M.; Yıldırım, B.; Say, A.; Ali, S.; Aytaç, S.; Nadeem, M. Artificial intelligence models for validating and predicting the impact of chemical priming of hydrogen peroxide (H2O2) and light emitting diodes on in vitro grown industrial hemp (Cannabis sativa L.). PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 2024, 114, 33-.
34. Nadeem, M. Advancements in QTL Mapping and GWAS Application in Plant Improvement. TURKISH JOURNAL OF BOTANY, 2024, 48, 376-426.
33. Aybar yalınkılıç, N.; Başbağ, S.; Nadeem, M.; Altaf, M.; Ali, A.; Baloch, F. Applicability of SCoT markers in unraveling genetic variation and population structure among sugar beet (Beta vulgaris L.) germplasm. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2024, 51, 584-.
32. Baloch, F. Unveiling the Genetic Tapestry: Exploring Rhizoctonia solani AG-3 Anastomosis Groups in Potato Crops across Borders. PLANTS, 2024, 13, -.
31. Yeken, M.; çelik, A.; Emiralioğlu, O.; çiftçi, V.; Baloch, F.; özer, G. Exploring differentially expressed genes in Phaseolus vulgaris L. during BCMV infection. PHYSIOLOGICAL AND MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, 2024, 130, -.
30. Kırdök, E. Metagenomic analysis of Mesolithic chewed pitch reveals poor oral health among stone age individuals. SCIENTIFIC REPORTS, 2024, 14, -.
29. Altaf, M.; Liaqat, W.; Jamil, A.; Jan, M.; Baloch, F.; Barutçular, C.; Nadeem, M.; Mohamed, H. Strategies and bibliometric analysis of legumes biofortification to address malnutrition. PLANTA, 2024, 260, -.
28. Baloch, F. Pattern-Triggered Immunity and Effector-Triggered Immunity: crosstalk and cooperation of PRR and NLR-mediated plant defense pathways during host–pathogen interactions. PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY OF PLANTS, 2024, 30, -.
27. Ali, A.; Shahbaz, M.; ölmez, F.; Fatima, N.; Umar, U.; Ali, M.; Akram, M.; Seelan, J.; Baloch, F. RNA interference: a promising biotechnological approach to combat plant pathogens, mechanism and future prospects. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2024, 40, -.
26. Nadeem, M. Advancements in QTL Mapping and GWAS Application in Plant Improvement. TURKISH JOURNAL OF BOTANY, 2024, 48, -.
25. Aybar yalınkılıç, N.; Başbağ, S.; Altaf, M.; Ali, A.; Nadeem, M.; Baloch, F. Applicability of SCoT markers in unraveling genetic variation and population structure among sugar beet (Beta vulgaris L.) germplasm. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2024, 51, -.
24. Sümbül, A.; Yıldız, E.; Sabır, A.; Nadeem, M. Investigation of genetic diversity among autochthonous grape cultivars grown in Türkiye using molecular primers. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2024, 71, -.
23. Altaf, M.; Liaqat, W.; Jamil, A.; Mohamed, H.; Fahad, M.; Jan, M.; Baloch, F. A Critical Review: Breeding Objectives, Genomic Resources, and Marker-Assisted Methods in Sorghum (Sorghum bicolor L.). JOURNAL OF SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION, 2024, , -.
2023
22. Güran, M.; çakıral, K.; Teralı, K.; Kandemir, T.; şanlıtürk, G.; Meral öcal, M.; Nağıyev, T.; Köksal, F. Meropenem in combination with baicalein exhibits synergism against extensively drug resistant and pan-drug-resistant Acinetobacter baumannii clinical isolates in vitro. OXFORD UNIVERSITY PRESS (OUP), 2023, 81, 1-11.
21. Almatar, M.; Albarri, O.; Lakhal, R.; Meral öcal, M.; Var öngel, I.; Köksal, F. Bacterial pathogens: Potential source for antimicrobial peptides. BENTHAM SCIENCE PUBLISHERS LTD., 2023, 24, 1-16.
20. Nadeem, M. Stripe rust resistance gene Yr15 in Turkish and Kazakhstan wheat germplasms and the potential of Turkish wild emmer for stripe rust breeding. GENETIC RESOURCES CROP EVOLATION, 2023, 70, 1-21.
19. Nadeem, M. Molecular characterization of divergent isolates of Citrus bent leaf viroid (CBLVd) from citrus cultivars of Punjab, Pakistan. FRONTIERS IN GENETICS, 2023, , 1104635-.
18. Sümbül, A.; Yıldız, E.; Nadeem, M. Elucidating the genetic variations among Turkish grape varieties using morphological and molecular markers. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2023, 70, 1349-1361.
17. Yıldız, E.; Sümbül, A.; Yaman, M.; Nadeem, M.; Say, A.; Baloch, F.; Popescu, G. Assessing the genetic diversity in hawthorn (Crataegus spp.) genotypes using morphological, phytochemical and molecular markers. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2023, 70, 135-146.
16. Karaköy, T.; Toklu, F.; Karagöl, E.; Uncuer, D.; çilesiz, Y.; Ali, S.; Nadeem, M.; özkan, H. Genome-wide association studies revealed DArTseq loci associated with agronomic traits in Turkish faba bean germplasm. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2023, 71, 181-198.
15. Baloch, F.; Alfat, M.; Bedir, M.; Nadeem, M.; Tatar, M.; Karaköy, T.; Asım, M. iPBS-retrotransposons variations: DNA fingerprinting and the evaluation of genetic diversity and population structure in international cowpea germplasm. GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2023, 70, 1867-1877.
14. Rissech, C.; Witzel, C.; Guardia, M.; López-costas, O.; Götherström, A.; Krzewinska, M.; Kırdök, E.; Mendiela, S.; Merino, M. Skeletal remains of human perinatal individuals from the fortified Iberian Period settlement of Ca n’Oliver (6th century to 50 years BCE). ARCHAEOLOGICAL AND ANTHROPOLOGICAL SCIENCES, 2023, 15, 28-.
13. Eker develi, E.; Tekdal, D.; Demet, A.; Yıldız, H.; Kıdeyş, A. Morphology, Molecular Genetics and Potential Importance for Mucilage Events of the New Coccolithophorid Ochrosphaera neapolitana in the Sea of Marmara. JOURNAL OF MARINE SCIENCE AND ENGINEERING, 2023, 11, 468-468.
12. Baran, N.; Shimira, F.; Nadeem, M.; Tanveer altaf, M.; Andırman, M.; Baloch, F.; Temiz, M. Exploring the genetic diversity and population structure of upland cotton germplasm by iPBS-retrotransposons markers. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2023, 50, 4799-4811.
11. Nadeem, M. Recent advancements in the breeding of sorghum crop: current status and future strategies for marker-assisted breeding.. FRONTIERS IN GENETICS, 2023, , -41150616.
10. Yılmaz, H.; özer, G.; Baloch, F.; çiftçi, V.; Chung, Y.; Sun, H. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of MTP (Metal Ion Transport Proteins) Genes in the Common Bean. MDPI AG, 2023, 12, -.
9. Baloch, F.; Nadeem, M.; HatipoÄŸlu, R. Molecular characterization of divergent isolates of Citrus bent leaf viroid (CBLVd) from citrus cultivars of Punjab, Pakistan. FRONTIERS IN GENETICS, 2023, 13, -.
8. çelik, A.; Emiralioğlu, O.; Yeken, M.; çiftçi, V.; özer, G.; Kim, Y.; Baloch, F.; Chung, Y. A novel study on bean common mosaic virus accumulation shows disease resistance at the initial stage of infection in Phaseolus vulgaris. FRONTIERS MEDIA SA, 2023, 14, -.
7. Asım, M.; Ali, S.; Altaf, Â.; Aali, A.; Nadeem, M.; Baloch, F. Artificial neural network and decision tree facilitated prediction and validation of cytokinin-auxin induced in vitro organogenesis of sorghum (Sorghum bicolor L.). SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 153, -.
6. Kırdök, E. aMeta: an accurate and memory-efficient ancient metagenomic profiling workflow. GENOME BIOLOGY, 2023, 24, -.
5. çilesiz, Y.; Nadeem, M.; Gürsoy, N.; Kul, R.; Karaköy, T. Assessing the cooking and quality traits diversity in the seeds of faba bean germplasm. THE SCIENTIFIC AND TECHNOLOGICAL RESEARCH COUNCIL OF TURKEY (TUBITAK-ULAKBIM) - DIGITAL COMMONS JOURNALS, 2023, 47, -.
4. Baloch, F.; Nadeem, M.; Baran, N. Exploring the genetic diversity and population structure of upland cotton germplasm by iPBS-retrotransposons markers. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2023, 50, -.
3. Baloch, F.; Altaf, M.; Bedir, M.; Nadeem, M.; Tatar, M.; Karaköy, T.; Aasım, M. iPBS-retrotransposons variations: DNA fingerprinting and the evaluation of genetic diversity and population structure in international cowpea germplasm. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 70, -.
2. Karaköy, T.; Toklu, F.; Karagöl, E.; Uncuer, D.; çilesiz, Y.; Amjad, A.; Nadeem, M.; özkan, H. Genome-wide association studies revealed DArTseq loci associated with agronomic traits in Turkish faba bean germplasm. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 71, -.
1. Yıldız, E.; Sümbül, A.; Yaman, M.; Nadeem, M.; Say, A.; Baloch, F.; Popescu, G. Assessing the genetic diversity in hawthorn (Crataegus spp.) genotypes using morphological, phytochemical and molecular markers. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, , -.
